巣山古墳の造り出しの写真は面白かったです。しかし、発掘調査というのはどのように行っているのでしょうか。場所全体が遺跡だとすると、足跡など絶対付けられないと思うのですが。

まあそうですね。ただし、遺跡の埋没している地層には幾重にも新しい土砂の層が堆積していますので、まず小規模の穴で試掘をしてから、だんだんと目的の層へ向かって地面を削り取ってゆく形になります。全面遺跡といっても、その面のすべてに重要な遺物・遺構があるわけではありませんので、（もちろん慎重さは欠かせませんが）ある程度歩き回りながら、土の色やその形状に注意しながら発掘してゆくことは可能なわけです。