これまでの「世界史」が「歴史基礎」「地理基礎」に変わったとき、「日本史」には制度的な変化が生じるのでしょうか。

提案には、日本史関係のことは書かれていないようです。日本史教育を基軸に据えて、そこから関連するトピックを通じ、世界史を把握してゆこうという「歴史基礎」なのでしょう。しかし、それで充分な世界史教育ができるのか、疑問の点もあります。あくまで「歴史基礎」を導入として扱い、世界史への関心を喚起して、その後世界史をしっかり教えてゆく、ということだと思うのですが…。いずれにしても、日本史については、今のところ大きな変化はないようです。