律令に関して、医師から医博士にかけて記述順が官位相当の順番に沿っていませんが、何か理由があるのですか。

恐らく、博士（教授）と学生をペアで書くためでしょう。陰陽寮でも、陰陽師のあとに、陰陽博士・陰陽生、暦博士・暦生、天文博士・天文生、漏刻博士・漏刻生、の順になっています。