「独自」という言葉は、いったい何を意味するのでしょう。

これも、その意味をハッキリ定義して用いないと誤解を招きますね。皆さんのコメントにあったように、中国や朝鮮の影響を受けていないという意味なら、国風文化を列島「独自」の文化とするのは間違いです。しかし、それらと交渉しつつオリジナルとは異なる形へ変化を遂げた、その形態はもはや中国や朝鮮にもないオリジナリティを獲得している、という意味なら「独自」といえるでしょう。