卜部は卜占を担当するとのことでしたが、卜部兼好の祖先はその卜部ですか?

そのとおりです。卜占の官が神話=歴史を叙述・管理することは日本でも受け継がれ、卜部=吉田家は日本紀注釈の家となり、最終的にはそこから発展して、吉田兼倶に至って唯一神道=吉田神道を生み出してゆくことになるのです。